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8:30 - 9:00 (30min)
Accueil
Accueil
9:00 - 9:10 (10min)
Présentation de la journée, les nouvelles du réseau
MIO Amphi
BIOTIC
9:10 - 10:00 (50min)
Identification of thermoadaptation fingerprints in three-dimensional protein structures using machine learning and persistent homology
MIO Amphi
Keynote Céline BROCHIER-ARMANET (LBBE)
10:00 - 10:20 (20min)
Métagénomique, métatranscriptomique et écosystèmes microbiens
MIO Amphi
› Tracking down microbial primary producers from the serpentinite-hosted Prony Bay hydrothermal field via metagenomics
- Rabja Popall, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO)
10:00-10:20 (20min)
10:20 - 10:50 (30min)
Pause café
MIO Hall
10:50 - 11:40 (50min)
Sécurité des données, parcimonie et spécificité. De nouveaux outils d’IA pour lutter contre les problèmes persistants.
MIO Amphi
Keynote William RITCHIE (IGH)
11:40 - 12:00 (20min)
Statistique, apprentissage automatique et IA pour la biologie et la santé
› Benchmarking Data Leakage on Link Prediction in Biomedical Knowledge Graph Embeddings
- Galadriel BRIERE, Aix Marseille Univ, INSERM, MMG, Marseille, France
11:40-12:00 (20min)
12:00 - 12:25 (25min)
FLASH TALKS
MIO Amphi
12:15 - 14:00 (1h45)
Poster Session
Miam + Posters
12:25 - 14:00 (1h35)
Déjeuner
MIO Hall
14:00 - 14:50 (50min)
End of the beginning: long-read genome assemblies of hybrid parasitic worms reveal unusual chromosome ends
MIO Amphi
Keynote Etienne DANCHIN (Sophia Agrobiotech)
14:50 - 15:10 (20min)
Génomique fonctionnelle et intégrative
› Exonic enhancers are a widespread class of dual-function regulatory elements
- Jean-Christophe Mouren, Theories and Approaches of Genomic Complexity
14:50-15:10 (20min)
15:10 - 15:30 (20min)
Discussion autour de la bioinformatique pour le GT stratégie scientifique AMU
MIO Amphi
Christine Brun (TAGC)
15:30 - 16:00 (30min)
Pause café
MIO Amphi
16:00 - 16:20 (20min)
Biologie des systèmes
MIO Amphi
› Dissecting microbe-host relationships via interface-resolved protein interaction networks
- Andreas Zanzoni, Theories and Approaches of Genomic Complexity
16:00-16:20 (20min)
16:20 - 16:40 (20min)
Workflows, reproductibilité et science ouverte
MIO Amphi
› Detect de novo expressed ORFs in transcriptomes with DESwoMAN
- Anna Grandchamp, Aix Marseille University, INSERM, TAGC, UMR_S1090, Marseille, France
16:20-16:40 (20min)
16:40 - 17:00 (20min)
Cloture
MIO Amphi
BIOTIC
